วัดหมื่นสารเป็นวัดเก่าแก่วัดหนึ่งในเชียงใหม่ สร้างขึ้นมาในสมัยราชวงศ์มังราย โดยปรากฏหลักฐานว่าสร้างขึ้นในปี พ.ศ. 1981 ในสมัยพญาสามฝั่งแกน กษัตริย์องค์ที่ 8 แห่งราชวงศ์มังราย วัดหมื่นสารในสมัยราชวงศ์มังรายเป็นวัดที่ถือพุทธศาสนานิกายลังกาวงศ์ และมีความสัมพันธ์กับวัดสวนดอก ในสมัยพระเจ้าติโลกราช กษัตริย์องค์ที่ 9 แห่งราชวงศ์มังราย (พ.ศ. 1984-2030) พบว่าเจ้าอาวาสวัดหมื่นสารเป็นหลานของเจ้าอาวาสวัดสวนดอก และในสมัยพระเจ้าติโลกราชนั้นปรากฏในตำนานมูลศาสนาว่าได้มีการสร้างวิหารวัดหมื่นสารแล้วได้มีการอาราธนาพระพุทธรูปชื่อพระศีลาเจ้าจากวัดป่าแดงมาประดิษฐานที่ในวิหารวัดหมื่นสาร เพื่อความจำเริญรุ่งเรืองในพระพุทธศาสนาต่อไป และต่อมาเมื่อเจ้าอาวาสวัดหมื่นสารชื่อพระพุทธญาณเสียมรณภาพในปี พ.ศ. 2031 พญายอดเมือง กษัตริย์ราชวงศ์มังรายองค์ที่ 10 (พ.ศ. 2030-2038) ได้นิมนต์พระมหาพุกามญาณสา มาดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาสวัดหมื่นสารแทน
ในปี พ.ศ. 2065 สมัยพระเมืองแก้ว กษัตริย์องค์ที่ 11 แห่งราชวงศ์มังราย มีหลักฐานทางเอกสารแสดงให้เห็นว่าวัดหมื่นสารเป็นวัดสำคัญวัดหนึ่งในสมัยราชวงศ์มังราย โดยมี “หมื่นหนังสือ” เป็นผู้สร้างวิหารครั้งแรก และเป็นแหล่งเรียนรู้อักขระที่สำคัญแห่งหนึ่งในสมัยพระเมืองแก้ว ซึ่งได้ใช้เป็นสถานที่แปลราชสาสน์ และในครั้งนั้นคงมีการถวายที่ดินและข้าวัดไว้จำนวนหนึ่งเพื่อดูแลวัด ดังนั้นชุมชนหมื่นสารจึงปรากฏมาตั้งแต่ราชวงศ์มังรายสืบมา
